HIV-1 neutralization by monoclonal antibody against conserved region 2 and patterns of epitope exposure on the surface of native viruses

Table 1 Alignment of amino acid sequences of the Env glycoprotein gp120 at position 218 to 239.

	Clade	Accession no.	218	219	220	221	222	223	224	225	226	227	228	229	230	231	232	233	234	235	236	237	238	239	240
C2E			D	E	P	I	P	I	H	Y	C	T	P	A	G	Y	A	I	L	K	C	N	D	K	N
NP1525	AE	AAW57720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K
MENO23	AE	AY621208	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
MENO43	AE	AY621222	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
92BR025	C	AAB61124	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	.	T
DU174	C	DQ411853	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	K
SF162	B	P19550	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	F	.	.	.	.	.	.	.	.	K
QH0692	B	AY669730	F	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	F	.	.	.	.	.	.	N	.	T
IIIB	B	AB037858	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	F	.	.	.	.	.	.	N	.	T
MN	B	P05877	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	F	.	.	.	.	.	.	.	.	K
VI191	A	ABY26917	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	F	.	.	.	.	.	R	.	.	E
92RW009	A	AY669700	F	.	.	.	.	.	N	.	.	A	.	.	.	F	.	.	.	.	.	K	.	.	K
92UG024	D	AAT67532	E	.	.	.	.	.	.	.	.	A	.	.	.	F	.	.	.	.	.	.	N	.	M